Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Fam171bQ14CH0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Fam171bQ14CH0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Fam171bQ14CH0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Fam171bQ14CH0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam171bQ14CH0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Fam171bQ14CH0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Fam171bQ14CH0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Fam171bQ14CH0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Fam171bQ14CH0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fam171bQ14CH0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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