Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Traf3ip1Q149C2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Traf3ip1Q149C2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Traf3ip1Q149C2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Traf3ip1Q149C2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf3ip1Q149C2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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