Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtel1Q0VGM9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtel1Q0VGM9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms