Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col19a1Q0VF58 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col19a1Q0VF58 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms