Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp2b3Q0VF55 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp2b3Q0VF55 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms