Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spata18Q0P557 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spata18Q0P557 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spata18Q0P557 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms