Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrioQ0KL02 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TrioQ0KL02 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms