Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn2bQ0KL01 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ubxn2bQ0KL01 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms