Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnnm1Q0GA42 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnnm1Q0GA42 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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