Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cass4Q08EC4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms