Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb2Q08331 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms