Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CbfbQ08024 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms