Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3bp2Q06649 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp2Q06649 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms