Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sox12Q04890 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox12Q04890 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms