Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Emx1Q04742 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms