Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms