Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smpd1Q04519 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smpd1Q04519 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms