Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mmp11Q02853 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mmp11Q02853 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms