Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gjb5Q02739 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb5Q02739 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms