Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nhlh1Q02576 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nhlh1Q02576 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms