Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htr1fQ02284 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms