Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RykQ01887 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RykQ01887 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RykQ01887 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RykQ01887 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RykQ01887 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RykQ01887 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RykQ01887 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RykQ01887 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RykQ01887 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RykQ01887 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RykQ01887 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RykQ01887 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RykQ01887 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RykQ01887 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RykQ01887 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RykQ01887 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RykQ01887 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RykQ01887 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RykQ01887 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RykQ01887 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RykQ01887 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RykQ01887 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RykQ01887 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RykQ01887 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RykQ01887 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms