Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbp1Q01514 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbp1Q01514 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms