Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sec23aQ01405 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec23aQ01405 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms