Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp1Q00915 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp1Q00915 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms