Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbp4Q00724 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbp4Q00724 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms