Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Apoa1Q00623 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apoa1Q00623 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms