Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shc1P98083 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shc1P98083 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms