Protein–RNA interactions for Protein: P98063

Bmp1, Bone morphogenetic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp1P98063 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bmp1P98063 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms