Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gata5P97489 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gata5P97489 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gata5P97489 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gata5P97489 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata5P97489 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata5P97489 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gata5P97489 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms