Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smyd1P97443 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smyd1P97443 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms