Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ElocP83940 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ElocP83940 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ElocP83940 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElocP83940 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElocP83940 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElocP83940 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElocP83940 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElocP83940 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElocP83940 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElocP83940 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElocP83940 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElocP83940 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ElocP83940 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElocP83940 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElocP83940 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElocP83940 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElocP83940 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElocP83940 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ElocP83940 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElocP83940 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElocP83940 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElocP83940 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ElocP83940 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElocP83940 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ElocP83940 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElocP83940 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElocP83940 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElocP83940 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElocP83940 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElocP83940 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElocP83940 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElocP83940 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElocP83940 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElocP83940 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ElocP83940 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ElocP83940 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElocP83940 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElocP83940 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElocP83940 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElocP83940 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElocP83940 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElocP83940 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElocP83940 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElocP83940 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElocP83940 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ElocP83940 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElocP83940 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElocP83940 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElocP83940 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElocP83940 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElocP83940 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElocP83940 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElocP83940 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ElocP83940 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElocP83940 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElocP83940 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElocP83940 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElocP83940 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElocP83940 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ElocP83940 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElocP83940 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElocP83940 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElocP83940 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ElocP83940 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElocP83940 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElocP83940 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElocP83940 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElocP83940 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElocP83940 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElocP83940 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ElocP83940 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ElocP83940 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ElocP83940 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ElocP83940 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ElocP83940 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ElocP83940 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ElocP83940 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ElocP83940 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ElocP83940 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms