Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gbx1P82976 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbx1P82976 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms