Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx2P81066 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx2P81066 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx2P81066 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx2P81066 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Irx2P81066 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms