Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cct5P80316 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cct5P80316 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cct5P80316 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cct5P80316 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms