Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tp53bp1P70399 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tp53bp1P70399 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms