Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx3P70354 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx3P70354 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx3P70354 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx3P70354 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx3P70354 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx3P70354 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msx3P70354 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms