Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgif1P70284 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms