Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Surf6P70279 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf6P70279 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Surf6P70279 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf6P70279 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf6P70279 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf6P70279 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf6P70279 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf6P70279 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf6P70279 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Surf6P70279 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Surf6P70279 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms