Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra8P70278 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra8P70278 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stra8P70278 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stra8P70278 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stra8P70278 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stra8P70278 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stra8P70278 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stra8P70278 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stra8P70278 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stra8P70278 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stra8P70278 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stra8P70278 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms