Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxd13P70217 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd13P70217 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms