Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plxna3P70208 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plxna3P70208 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms