Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrig1P70193 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrig1P70193 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms