Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnab1P63143 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms