Protein–RNA interactions for Protein: P63137

Gabrb2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb2P63137 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabrb2P63137 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrb2P63137 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms