Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabra1P62812 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gabra1P62812 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms