Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snrpd2P62317 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd2P62317 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd2P62317 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd2P62317 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd2P62317 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd2P62317 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd2P62317 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd2P62317 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd2P62317 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd2P62317 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd2P62317 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd2P62317 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd2P62317 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd2P62317 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms