Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm3P62311 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms