Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps11P62281 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps11P62281 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps11P62281 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps11P62281 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps11P62281 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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