Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vbp1P61759 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vbp1P61759 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms